General Sefer Halilović je optužen za kršenja ratnog prava i običaja zbog ubojstva više od 60 bosanskih Hrvata u selima Grabovica i Uzdol tijekom operacije Armije BiH "Neretva 93".
Kao zamjenik zapovjednika glavnog stožera Armije BiH Rasima Delića, optuženi je u rujnu 1993. zapovijedao operacijom NERETVA - 93, čiji je cilj bio zauzimanje teritorija koji se nalazio u rukama HVO-a od Bugojna do Mostara, radi deblokade Mostara
Suđenje je pred Haškim sudom počelo 19. siječnja 2004. godine, a Halilović se dobrovoljno predao Sudu 25. rujna 2001. godine. On se prilikom prvog pojavljivanja pred Haškim sudom izjasnio da se ne osjeća krivim.