AI međutim izražava žaljenje što su dijelovi izvješća krivo interpretirani, tvrdeći kako u izvješću, nikad nisu izrazili mišljenje o tome tko je počeo rat na području bivše Jugoslavije i nisu po tom pitanju zauzimali nikakav stav u bilo kom drugom kontekstu.
Organizacija u svom priopćenju naglašava da su svi nalazi u izvješću temeljeni na službenim informacijama i statistikama koje su AI-ju između 2007. i 2010. ponudili predstavnici hrvatskih vlasti, ne precizirajući o kojim se hrvatskim institucijama radilo.
AI navodi da je izvješće, koje je na 77 stranica objavilo 9. prosinca 2010. godine, dva tjedna prije objavljivanja ponudilo hrvatskim vlastima kako bi iznijele svoje eventualne primjedbe ali da do objavljivanja nije dobilo nikakav komentar.
Amnesty International kaže da je danas doznao kako je hrvatsko ministarstvo pravosuđa svoje reagiranje na izvješće predstavilo medijima, izražavajući žaljenje što odgovor ministarstva nije dobilo prije medija.
Na kraju priopćenja AI kaže da će pomno analizirati odgovor hrvatskih vlasti na izvješće i o svom stavu obavijestiti javnost.