Ova postrojba ustrojena je Odlukom MUP-a RH, na samom početku Domovinskog rata, 23. srpnja 1991. godine, a vrlo brzo je u potpunosti popunjena, i to prije svega dragovoljcima iz PU zagrebačke koji su u MUP RH stupili nakon višestranačkih izbora u Hrvatskoj, ali isto tako i ljudima koji su prije radili u policiji, čija su znanja, odlučnost i želja da se politička volja svog naroda provede u stvarnost, bili iznad svega.
Postrojba ALFA sudjelovala je, u svim borbenim akcijama u obrani suverenosti i uspostavi teritorijalne cjelovitosti Republike Hrvatske. U navedenim akcijama svoje živote položilo je osam njezinih pripadnika, a više od stotinu je ranjeno.
Posljednjim preustrojem specijalne policije MUP-a RH, u kolovozu 2008. godine, SJP Alfa je spojena je sa ATJ Lučko.
Njeni najsposobniji i najbolje psihofizički pripremljeni pripadnici sada su dio ATJ Lučko, a drugi dio pripadnika okosnica su Interventne jedinice PUZ-a.
Specijalna jedinica policije ALFA tijekom Domovinskog rata sudjelovala je u akcijama Topusko, Velika Buna, Trokut, Poskok I., Maslenica, Pokupsko, Medački Džep, Poskok II., Kocka, Pakrac-Požega, Bljesak, Oluja, Nauk, a sama postrojba više puta je odlikovana.
U sklopu postrojbe, od rujna 1991. postojala je i posebna studentska postrojba MiG, sastavljena od studenata i profesora ondašnjeg Fakulteta za fizičku kulturu, današenjega Kineziološkog fakulteta, u kojoj je bilo 88 studenata, a njih 8 bili su s drugih fakulteta.