Tužiteljstvo 72-godišnju Brajšu sumnjiči da je odgovorna jer od početka 2001. do kraja 2004. kao ravnateljica Caritasa nije ustrojila i vodila poslovne knjige radi obračunavanja i plaćanja poreza na dohodak, te doprinosa za mirovinsko i zdravstveno osiguranje i za zapošljavanje.
Tereti ju se i da je djelatnicima računovodstva davala naloge da se prijave i plaćanja poreza i doprinosa ne izvrše u cijelosti. Time je, tvrde u tužiteljstvu, za Caritas nezakonito priskrbila oko 2,7 milijuna kuna, odnosno za toliki iznos je oštetila državni proračun.
Tužiteljstvo je Brajšu prijavilo za povredu obveze vođenja trgovačkih i poslovnih knjiga te zlouporabu ovlasti u gospodarskom poslovanju. Kažu da su navodnim nezakonitostima prekršene odredbe Uredbe o računovodstvu neprofitnih organizacija, Pravilnika o knjigovodstvu i računskom poslovanju neprofitnih organizacija te Općeg poreznog zakona.
Brajšin odvjetnik Silvije Degen nije bio dostupan za komentar.
Predistraga protiv Brajše pokrenuta je početkom srpnja 2005., nakon napisa u tisku o njezinom navodnom nezakonitom stjecanju imovine. Krajem lipnja prošle godine tužiteljstvo je zaprimilo izvješće Porezne uprave koja je otkrila nepravilnosti u poslovanju Caritasa, pa je od policije i poreznika zatražilo dodatni nadzor.
U ožujku prošle godine Kaptol je objavio da je vizitacija u Caritasu utvrdila propuste u financijskom i knjigovodstvenom poslovanju, ali ne i pronevjere. Vizitaciju je osam mjeseci ranije, nakon izbijanja afere o zlostavljanju djece u Caritasovu domu u Brezovici, naložio zagrebački nadbiskup kardinal Josip Bozanić.
U jeku afere oko seksualnog zlostavljanja u Caritasovom domu u Brezovici, kardinal Bozanić je Brajšu u kolovozu 2005. razriješio dužnosti zbog, kako je tada rečeno, zdravstvenih razloga.