Od ukupno 29 osumnjičenika, većinom Marokanaca, sedam se smatra najvećim krivcima, i za svakog od njih tužiteljstvo traži kaznu zatvora u trajanju od gotovo 40 tisuća godina iako nijedan od njih, bude li osuđen, ne može služiti više od 40 godina u zatvoru, što je u Španjolskoj zakonski maksimum.
Šestorica Arapa optužena su za planiranje ili izvedbu napada, a sedmi, Španjolac, označen je "neophodnim kolaboracionistom" koji ih je opskrbio dinamitom. Jedanaest osoba za koje se smatra da su sudjelovale u napadu neće biti u sudnici.
Sedam ih je, uključujući i Tunižanina Serhana ben Abdelmadžida Faketa, koji se smatra organizatorom cijele akcije, aktiviralo bombu i raznijelo se kad je, tri tjedna poslije napada na vlakove, policija okružila stan u kojem su se nalazili u Leganesu nedaleko od Madrida.
Za jednog se osumnjičenika vjeruje da je poginuo u samoubilačkom bombaškom napadu u Iraku, a trojica nisu nikad uhićena.