Prigodom potpisivanja protokola Turska je također objavila posebnu deklaraciju u kojoj naglašava da širenje carinske unije na Cipar ne znači i službeno priznanje te države.
Međutim, kako su ranije objavili u EU, službeno priznanje Cipra nije uvjet za početak pregovora s Turskom, ali uspostava carinske unije jest.
Bez ikakve službene ceremonije protokol je u ime EU potpisao britanski veleposlanik u Bruxellesu John Grant, a s turske strane njezin veleposlanik pri EU Oguz Demiralp.
"Potpisivanje, ratifikacija i primjena protokola nipošto ne znači priznavanje Republike Cipra na koju se protokol, među ostalima, odnosi", istaknulo je tursko ministarstvo vanjskih poslova u priopćenju. U njemu se također dodaje da Ankara nastavlja podupirati turski dio Cipra i napore UN-a za ujedinjenjem otoka.