Pacellijevo neobjavljeno pismo koje se čuva u Vatikanu, a objavio ga je dnevni list Osservatore Romano, pokazuje kako se potvrdilo prijateljstvo dvojice kolega iz gimnazije Visconti u Rimu: katolika Eugenija Pacellija i rabinova sina Guida Mendesa, rođenih 1876.
Na Mendesovu molbu kardinal Pacelli, tada još državni tajnik Svete Stolice, pisao je 21. siječnja 1939., msgr. Gustavu Testi, apostolskom nunciju za Jeruzalem i Palestinu sa sjedištem u Kairu. Testa je pomogao da Mendes dobije vizu britanskih vlasti početkom 1940. godine i emigrira u Palestinu.
Sergio Pagano, prefekt Vatikanskih arhiva, kojega citira Osservatore Romano, kazao je da je doktor Mendes bio uvjereni fašist, a istaknuo se u borbi protiv tuberkuloze. Kada je kao židov bio pogođen rasnim zakonima, obratio se 23. prosinca 1938., bivšem gimnazijskom kolegi tražeći pomoć za emigraciju i odlazak u Palestinu.
Desetljećima se povjesničari spore oko uloge Pija XII. (1939.-1958.), osumnjičenog za antisemitizam jer golemu snagu crkve nije iskoristio kako bi osudio holokaust.
Različita svjedočenja potvrđuju da je konkretnim mjerama spašavao židove u Rimu pomažući im da se skriju u samostanima.
Arhivi iz njegova pontifikata bit će dostupni tek za tri ili četiri godine, no povijesna rasprava ponovo se rasplamsala otkako je papa Benedikt XVI. u prosincu 2009., potpisao ukaz kojim otvara put za postupak proglašenja blaženim Pija XII.