Posljednjeg dana suđenja optuženici su iznijeli svoje završne govore u kojima su ponovili da nisu krivi za ubojstvo i zatražili od suda da ih oslobodi.
Ivo Pukanić, jedan od najeksponiranijih novinarskih imena u Hrvatskoj, ubijen je 23. listopada 2008. eksplozivnom napravom skrivenom u skuteru na parkiralištu pokraj redakcije tjednika "Nacionala" koji je utemeljio i čiji je bio suvlasnik. Kao kolateralna žrtva poginuo je njegov suradnik Niko Franjić, a ozlijeđene su i dvije osobe te je oštećeno više vozila i zgrada.
Nedugo nakon ubojstva, o kojem su izvijestili mnogi svjetski mediji, pokrenuta je policijska akcija "Balkan ekspres" u kojoj su uhićeni bratići Robert i Luka Matanić, Amir Mafalani i Slobodan Đurović.
Krajem prošle godine Željko Milovanović, koji je prema optužnici skuter s eksplozivom parkirao kraj Pukanićevog terenca, uhićen je u Beogradu gdje mu se sudi zajedno s Milenkom Kuzmanovićem i Setenom Jocićem, koji je navodno organizirao ubojstvo u ime nepoznatog krajnjeg naručitelja povezanog s međunarodnom duhanskom mafijom. Dva dana prije početka zagrebačkog suđenja u Banja Luci se predao Bojan Gudurić koji je potom izručen Hrvatskoj.
Nakon jednogodišnje istrage, 26. listopada 2009. USKOK je podigao optužnicu u kojoj je Roberta i Luku Matanića, Mafalanija, Milovanovića, Gudurića i Đurovića, osim za ubojstva iz koristoljublja tereti i za teško kazneno djelo protiv opće sigurnosti i udruživanje u zločinačku organizaciju.
Prema optužnici Pukanićevo je ubojstvo organizirano kako bi ga se onemogućilo da u medijima u Hrvatskoj i susjednim zemljama iznosi saznanja o djelovanju više kriminalnih grupa na tim prostorima. Zločinačku organizaciju koja ga je likvidirala navodno je u Srbiji u prvoj polovici 2008. organizirao Sreten Jocić koji je za Pukanićevo ubojstvo platio 1,5 milijuna eura. Za vezu između Jocića i neposrednih izvršitelja optužen je njegov kum Slobodan Đurović.
Na suđenju koje je počelo 3. veljače uz stroge mjere osiguranja i koje je s ljetnom stankom trajalo nešto manje od devet mjeseci provedena su brojna vještačenja, pregledane snimke, razgovori i sms poruke optuženika ali i ubijenog Pukanića te su ispitani brojni svjedoci. Uz krunskog svjedoka Tomislava Marjanovića i poduzetnika Ratka Kneževića koji je ustvrdio da iza ubojstva stoji crnogorska duhanska mafija medijsku je pažnju privuklo i nedavno svjedočenje zagrebačkog policajca Nenada Šipušića. On je, naime, potvrdio da mu je Amir Mafalani najavio zločin ali da mu nije rekao gdje će se dogoditi i tko će biti žrtva ili počinitelj pa on to nije prijavio nadređenima.
Pred kraj suđenja USKOK je sudu predao izmijenjenu optužnicu protiv šestorice navodnih atentatora u kojoj prvi put navodi imena Hrvoja i Novice Petrača kao mogućih žrtava zločinačke skupine.
U završnom govoru zamjenik ravnatelja USKOK-a Slobodan Šašić zatražio je najveću zakonsku kaznu od 40 godina zatvora za optužene atentatore na Pukanića, ustvrdivši da je to bio najnasilniji čin u povijesti Hrvatske i zločin protiv novinarske riječi i demokracije. Optuženici su pak zanijekali krivnju, a njihove su obrane ustvrdile da USKOK nije dokazao postojanje zločinačke organizacije.