Inženjer po struci, Brđanin (59) je u politiku ušao neposredno prije početka rata u BiH, a 1992. je bio na položaju predsjednika Kriznog stožera tzv. Autonomne regije Krajina (ARK), područja pod nadzorom Srba na sjeverozapadu BiH. Protiv njega je podignuta optužnica, a uhitio ga je 1999. SFOR u BiH, kad je bio zastupnik u skupštini RS.
Presudom prvostupanjskog vijeća utvrđeno je kako je imao vodeću ulogu u koordiniranju kampanje etničkog čišćenja Bošnjaka i Hrvata s tog područja pa je 1. rujna 2004. osuđen na 32 godine zatvora. Proglašen je krivim po individualnoj odgovornosti za osam od 12 točaka optužnice, uključujući progon na vjerskoj, političkoj i rasnoj osnovi kao zločin protiv čovječnosti, dok je oslobođen krivnje za genocid, suučesništvo u genocidu, istrebljenje, te protupravno razaranje i oduzimanje imovine.
Drugosupanjsko vijeće, koje je odlučivalo o prizivu na tu presudu, u utorak mu je smanjilo kaznu na 30 godina zatvora i potvrdilo oslobađajuću presudu prvostupanjskog vijeća po optužnici za genocid. Presude prizivnog vijeća ICTY-a su konačne.
Brđanin (59) je bio optužen za etničko čišćenje muslimanskog i hrvatskog pučanstva s područja tzv. Krajine na sjeverozapadu BiH 1992. godine.