Komšić je potkraj prošloga tjedna u otvorenom pismu kardinalu Puljiću postavio pitanje: "Je li moj izbor za člana Predsjedništva BiH u ime hrvatskog naroda a priori štetan i poguban za hrvatski narod, te je li mojim izborom zaista učinjena, kako ste izjavili nedavno u Zagrebu, 'nepravda' prema hrvatskom narodu u BiH?"
Komentirajući Komšićevo otvoreno pismo, msgr. Tomašević rekao je, u mostarskom Dnevnom listu od utorka, kako je kardinal Puljić s Komšićem razgovarao o lokaciji za gradnju crkve u novosarajevskom naselju Grbavica, ali da tom prilikom "Komšić nije pokazao posebnu otvorenost". Msgr. Tomašević je dodao kako kardinal Puljić nema namjeru medijskim prepiskama razgovarati s Komšićem.
Izbor Komšića za hrvatskog člana Predsjedništva BiH, kojeg je na tu dužnost kandidirala Socijaldemokratska partija BiH (SDP BiH) predmetom je osporavanja hrvatskih političkih i javnih dužnosnika u BiH. Komšiću se najviše zamjera što je na dužnost hrvatskog člana Predsjedništva BiH izabran većinom bošnjačkim glasovima simpatizera SDP-a BiH. Pri tomu se redovito ističe kako Komšićev izbor nije nezakonit, ali da je nelegitiman jer nema potporu Hrvata u BiH. Posebice se zamjera SDP-u BiH što je iz Federacije BiH predložila samo kandidata za hrvatskog člana Predsjedništva BiH (Komšića), a ne i kandidata za bošnjačkog člana Predsjedništva BiH, čime je omogućeno da brojčano nadmoćniji Bošnjaci, koji čine golemu većinu SDP-ovih simpatizera, izaberu hrvatskog člana Predsjedništva BiH.
HDZ BiH je zatražila da Komšić podnese ostavku jer ga na dužnost hrvatskog člana Predsjedništva BiH nisu izabrali Hrvati.
Predsjednici HDZ 1990. Božo Ljubić i HSP BiH (Đapić-Jurišić) Zvonko Jurišić izrazili su spremnost surađivati s Komšićem, ali pod uvjetom ako on bude zastupao interese hrvatskog naroda u BiH.