Izjavio je to zamoljen da komentira odluku saborskog Povjerenstvo za sprječavanje sukoba interesa koje je danas kao neutemeljenu, odbilo prijavu koju su protiv njega podnijeli bivši ministar znanosti Hrvoje Kraljević i akademik Vlatko Silobrčić tvrdeći da je Primorac bio u sukobu interesa, jer je radio na znanstvenom projektu "Jezgra 23". koji financira Ministarstvo.
Povjerenstvo je međutim utvrdilo da je odluka o dodjeli novca za taj projekt donesena 19. prosinca 2003., prije nego što je Primorac formalno stupio na dužnost ministra, a potpisao ju je njegov prethodnik Gvozden Flego.
Povjerenstvo je utvrdilo da su u znanstvenim projektima sudjelovali i bivši ministri, te da je Primorac, nakon godinu dana, izašao iz projekta i u cijelosti ga prepustio Institutu Ruđer
Bošković.