Aguirre je prošle sezone predvodio Osasunu do četvrte pozicije u prvenstvu i mjesta u kvalifikacijama Lige prvaka. Iako su čelnici kluba željeli da ostane, Meksikanac je prihvatio ponudu iz Madrida.
"Veliki je izazov voditi momčad Atletica kojoj je mjesto u vrhu španjolskog i europskog nogometa," poručio je Aguirre.
Bivši meksički izbornik na klupi Atletica naslijediti će Pepe Murciju, koji je bio prisiljen na odlazak nakon svega 10. mjestu Primere.