Glavna tema njegova razgovora s ministricom unutarnjih poslova Vesnom Gjerkeš Žnidar bile su promjene schengenskog pravilnika, koje je krajem rujna predložila Europska komisija, a kojima Slovenija nije zadovoljna jer predviđaju mogućnost produženih kontrola unutarnjih granica u Schengenu zbog sigurnosnih rizika.
Slovenija se u načelu ne protivi mogućnosti takve kontrole, ali drži da su kriteriji za to prelabavi, a nadzor na graničnim prijelazima koje je uvela Austrija nepotreban, kazala je nakon razgovora slovenska ministrica. Prema njenim je riječima ove godine u Sloveniju vraćeno samo 27 migranata koji su ilegalno prešli u susjednu državu, dok je povećan broj ilegalnih prijelaza s Hrvatskom koja nije u Schengenskom prostoru.
Avramopoulos je na konferenciji za novinare kazao da je Slovenija ključna država za čuvanje vanjske schengenske granice, ali da je suradnja Slovenije i Hrvatske u kontroli graničnog režima dobra, što je po ocjeni slovenske ministrice omogućilo i to što hrvatska policija sada koristi i podatke iz europskog schengenskog informacijskog sustava kako bi se pripremila za ulazak u Schengensku zonu.
Na pitanje novinara kako komentira neke najave da će Slovenija zbog bilateralnih pitanja blokirati ulazak Hrvatske u Schengenski prostor, Avramopoulos je kazao da o tome ne zna ništa.
"Uvjeren sam da do toga neće doći, jednom kad Hrvatska ispuni uvjete. U Europskoj uniji ne smijemo dopustiti da granice budu razlog za sporove među državama", kazao je Avramopoulos kojega je prilikom posjeta Ljubljani primio i premijer Miro Cerar.