Prema kalendaru natjecanja prve utakmice su na rasporedu 23. studenog, a uzvrati sedam dana kasnije, 30. studenog. Dinamo će zbog obveza u Ligi prvaka prvu utakmicu protiv Istre 1961 igrati 30. 11, a uzvratni susret je 10. ili 11. prosinca 2011. u Puli.
Uz suglasnost Glavnog tajnika HNS-a Zorislava Srebrića, klubovima je ostavljena mogućnost dogovora da se za odigravanje kup utakmica koriste i termini 12. i 16. studenog u pauzi prvenstva.
Ždrijeb parova četvrtfinala je održan pod vodstvom Nevena Kolića, predsjednika Povjerenstva za natjecanje Hrvatskog nogometnog kupa, a kuglice s imenima klubova izvlačili su predstavnici klubova sudionika četvrtfinala. Čast da prvi izvlači pripala je Tomislavu Viševiću kao predstavniku Vinogradara, jedinog drugoligaša koji je izborio nastup u četvrtfinalu.
PAROVI ČETVRTFINALA:
Dinamo - Istra 1961
Hajduk - Zagreb
Rijeka - Osijek
Cibalia - Vinogradar