Zahvaljujući umjetničkim djelima neprocjenjive vrijednosti Vatikanski muzeji našli su se među najposjećenijim muzejima svijeta, kojima je na čelu pariški Louvre sa 6 milijuna posjetitelja, a iza kojeg slijede newyorški Metropolitan Museum i londonski British Museum.
Vatikanski muzeji u Italiji gotovo da i nemaju pravih konkurenata. Godine 2005. Pompeje kod Napulja obišlo je 2.370.940 posjetitelja, Duždevu palaču u Veneciji 1.446.010, a spomenički kompleks Santa Croce i galeriju Uffizi u Firenci 1.433.779 i 1.342.558 posjetitelja.
Dok se nizom inicijativa, restauriranja novih postava i kupnji, među kojima je posljednji događaj izložba "Laokont - Na izvorima Vatikanskih muzeja", otvorena 16. studenog, nastavlja obilježavanje 500. obljetnice zbirke koja je nastala zahvaljujući renesansnom snu pape Julija II. i dok kilometarski redovi posjetitelja čekaju na ulazu, Vatikanski muzeji stalno jačaju svoj prestiž u svijetu i ciljaju na nove rekorde.
Od 2000., godine jubileja, Vatikanski muzeji stalno bilježe visok broj posjeta. Te ih je godine posjetilo 3,5 milijuna posjetitelja, a iduće 3.375.000.
Godine 2002. zabilježen je blagi pad, koji se može pripisati radnom vremenu, ali i posljedicama terorističkih napada 11. rujna, te je u toj godini muzeje obišlo 2.974.000 posjetitelja. Od 2003. godine, u kojoj je bilo 3.152.836 posjetitelja, broj posjetitelja stalno raste te je prošle godine dostigao 3.822.234 posjeta.