Srspka crkva kojoj je pripadala pastva u Makedoniji od osnivanja Kraljevine Jugoslavije nikada nije prihvatila osamostaljivanje makedonske crkve.
Poglavar makedonske crkve Stefan koji je služio liturgiju u ohridskoj crkvi Sveta Sofija, osvrnuo se u propovjedi na povijest Makedonske pravoslavne crkve. Istaknuo je da je još za vrijeme Narodno oslobodilačkog rata osnovan Inicijativni odbor za crkveno organiziranje, koji je odmah nakon rata donio odluku o obnavljanju Ohridske arhiepiskopije kao samostalne Makedonske pravoslavne crkve i potom uputio zahtjev srpskoj crkvi za osamostaljivanje.
Godine 1959. priznaje se samostalnost ali 1967. kada Sinod MPC proglašava autokefalnost, čin kojim su samostalnost stekle sve pravoslavne crkve, SPC povlači prethodnu odluku i do današnjih dana negira našu crkvu, rekao je g. Stefan.
Povremeni pregovori u proteklih 40 godina između srpske i makedonske crkve o potvrđivanju njene autokefalnosti nisu urodili plodom. Dapače, prije 4 godine Srpska pravoslavna crkva obnavlja Ohridsku arhiepiskopiju pod svojim patronatom i priznaje je kao jedinstvenu pravoslavnu crkvu u Makedoniji.
Razlozi za nepriznavanje Makedonske pravoslavne crkve su politički i iza toga stoji srpska država u savezu sa Grčkom, izjavio je g. Stefan u intervjuu za privatnu televiziju Sitel u subotu. Problem ostaje sve dok se ne riješi spor sa Grčkom oko imena Makedonije, konstatirao je on.
Prema povijesnim podacima, Ohridska biskupija postoji od 347. godine, a za vrijeme cara Samoila u desetom stoljeću postaje Arhiepiskopija pod čijom su jurisdikcijom sve susjedne zemlje i šire. Ukinuta je 1767. godine u vrijeme turske vladavine.