"Ministarstvo je nadležno za sudsku upravu, odnosno osiguranje uvjeta za rad poput osiguranja prostora, plaća, materijala", kazao je u telefonskom razgovoru Mikuličić, dodajući da se ono moglo baviti i pitanjima poput odgovornosti za zastaru predmeta.
Drugi Markačev branitelj odvjetnik Miroslav Šeparović, inače ministar pravosuđa u vrijeme "Oluje", u podnesku kojim je u ponedjeljak tražio da mu se omogući žalba na isključenje iz predmeta "Gotovina, Čermak, Markač" zapisao je da ni ministar pravosuđa, a ni ministar obrane nisu imali pravne ili stvarne ovlasti da interveniraju i kontroliraju rad sudova u Hrvatskoj, bilo vojnih bilo civilnih.
Odvjetnik generala Ante Gotovine Luka Mišetić je u odgovoru na taj podnesak, u kojem je sugeriran njegov propust, prenio iskaz potencijalnog svjedoka splitskog suca po kojem je Ministarstvo pravosuđa bilo zakonom obvezno na nadzor i praćenje rada civilnih i vojnih sudova, te je moglo započeti disciplinske postupke protiv sudaca vojnih sudova koji nisu ispunjavali svoje dužnosti, kao i razriješiti ih.