ZAGREB, 5. prosinca (Hina) - Zahvaljujući novom kompjutorskom programu, znanstvenici su otkrili nove segmente gena i zaključili da ljudski genom ima mnogo više gena nego što se pretpostavljalo.
ZAGREB, 5. prosinca (Hina) - Zahvaljujući novom kompjutorskom
programu, znanstvenici su otkrili nove segmente gena i zaključili
da ljudski genom ima mnogo više gena nego što se pretpostavljalo.
#L#
U istraživanju gena znanstvenici se služe kompjutorskim programima
koji analiziraju sekvence DNK. Ti programi pokazuju mjesto na
kojemu se dijelovi gena nalaze u golemoj i složenoj genetskoj
slici.
Iako uobičajeni programi s lakoćom otkrivaju mnoge dijelove gena,
oni ne mogu otkriti dva bitna elementa: prve dijelove gena i
obližnje "prekidače", odnosno promotore.
Istraživači uključeni u bioinformatički program laboratorija Cold
Spring Harbor napravili su kompjutorski program koji posebno
uspješno otkriva te prve segmenate i promotor gena. Program pod
nazivom "First Exon Finder" (Nalaznik prvog eksona) ili "FirstEF"
razvio je Michael Zhang u suradnji s kolegama, stoji u priopćenju za
novinare Američkoga društva za promicanje znanosti.
Članak o programu objavljen je u časopisu "Nature Genetics".
"FirstEF prvi je program koji može precizno otkriti one segmente
gena koje je dosad bilo iznimno teško naći", kaže Zhang. "To je
poput potrage za zakopanim blagom."
Segmenti gena o kojima Zhang govori nalaze se na samom početku gena
i zovu se "nekodirajući prvi eksoni". Budući da ne kodiraju
proteinske segmente, nemoguće ih je otkriti kompjutorskim
programima koji se temelje na modelima za kodiranje proteina u
DNK.
Unatoč činjenici da ne kodiraju protein, nekodirajući prvi eksoni
bitan su dio strukture i funkcije gena. Mogućnost otkrivanja
nekodirajućih prvih eksona ključna je za znanstvenike koji žele
istraživati gene u razne biološke i biomedicinske svrhe.
Analizirajući sekvence DNK ljudskih kromosoma 21 i 22 uz pomoć
programa FirstEF, Zhang je utvrdio da taj program točno pronalazi
mjesto 90 posto poznatih prvih eksona na tim kromosomima.
Kasnije su Zhang i suradnici koristili FirstEF za analizu cijelog
ljudskog genoma. Pronašli su 68.000 prvih eksona. To ne znači nužno
da postoji 68.000 ljudskih gena, jer samo jedan gen može imati više
prvih eksona. Osim toga, ukupan broj gena ovisi o drugim,
suptilnijim definicijama gena. Ipak, Zhang vjeruje da postoji 50 do
60.000 ljudskih gena te da su prijašnje procjene - 30 do 40.000,
pogrešne.
(Hina) lbr dgk
(Hina) lbr dgk