Početak psihoterapije u Hrvatskoj seže u 1948. godinu kada je, zahvaljujući profesorima Stjepanu Betlheimu i Dušku Blaževiću, u nekoliko podrumskih prostorija bolnice osnovan prvi psihoterapijski odjel u ovom dijelu Europe, sa šest psihoterapeuta.
Budući da se radilo o poratnom vremenu, već je tada liječen veliki broj pacijenata koji su patili od psihičkih smetnju. Prekretnica u djelovanju nastaje 1969. godine, kada odjel useljava u novu zgradu i dolazi do osnivanja Centra za mentalno zdravlje, a ubrzo zatim psihološka medicina postaje i zaseban predmet na Medicinskom fakultetu.
Ravnatelj KBC-a Željko Reiner istaknuo je kako je prihoterapijski odjel posebno značajnu ulogu imao 90-ih godina tijekom Domovinskog rata, te danas, kada zbrinjava brojne stradalnike, prvenstveno učesnike Domovinskog rada oboljele od PTSP-a.
Psihoterapijskom odjelu 50. obljetnicu su čestitali u ime pokrovitelja predsjednika Stjepana Mesića njegov savjetnik Esad Prohić, državni tajnik u Ministarstvu zdravstva i socijalne skrbi Veljko Božikov i pomoćnik ministrice obitelji, branitelja i međugeneracijske solidarnosti Herman Vukušić.