Mehaničke oruglje - s 18 registara, dva manuala i pedalom s pozitivom u korskoj ogradi i zasebnim sviraonikom - povijesni su instrument te vrijedno umjetničko ostvarenje Franza Vogta iz Pečuha,
Građene su oko 1850. godine, a prepravljane su godina 1926. i 1959.
No, kako se navodi u rješenju Uprave za zaštitu kulturne baštine, pažljivo su čuvane i njegovane, te danas posjeduju odličnu zvučnost, dobro prilagođenu crkvenom prostoru.
Orgulje u vinkovačkoj crkvi Sv. Euzebija i Poliona imaju i vrlo kvalitetno klasicističko kućište s dva krila, koja povezuju zajednički zabat.
Raskošno ornamentirane rezbarene zavjese prekrivaju kosinu svirala. Stolarija je obojena u boji bjelokosti, a plastična je dekoracija pozlaćena.