Komisija želi odgovoriti na poziv pape Ivana Pavla II. na pragu trećeg tisućljeća da svi narodi popišu svoje mučenike i da slijede njihovo vjerno svjedočenje.
Iako komisija nema za cilj cjeloviti popis stradalih za Drugoga svjetskog rata i poraća, jasno je da će raditi i na tome te poticati druge da se taj posao konačno dovrši, jer se inače i dalje ostavlja veliki prostor za razne nečasne manipulacije, kakvih je do danas bilo napretek.
Komisija će pomagati i poticati odgovorne da žrtve komunističkoga terora ostvare svoje civilizacijsko pravo na humani pokop i na dolično obilježje.
Bilo je govora i o "Svehrvatskom grobu", u kojemu bi našli svoje zadnje počivalište zemni ostaci neidentificiranih žrtava.
Komisija, u čijem su sastavu i članovi iz BiH, predlaže da se izradi cjeloviti nacionalni martirologij, a svaka biskupija, kao i svaka župa, odredi svoj dan sjećanja na svoje mučenike.