Milovanović, koji je na početku suđenja u travnju 2010. odbio iznijeti svoju obranu i najavio da će to učiniti kasnije tijekom postupka, u nastavku dokaznog postupka ustvrdio je kako mu nije namjera time odugovlačiti postupak već da mu treba više vremena.
Predsjednik sudskog vijeća Vladimir Vučinić kazao je Milovanoviću kako će mu biti omogućeno vrijeme te da će najbolje biti da se optuženi sam javi kada bude spreman iznijeti obranu, te dodao kako će sudski postupak u međuvremenu ići svojim tijekom.
Postupak je potom nastavljen čitanjem sudskih spisa i izjava svjedoka ispitanih u Zagrebu, među kojima Egona Majera i Frane Domančića, kao i svjedoka pod pseudonimom “Koko“ i svjedoka označenih brojevima od jedan do šest.
Obrana trećeoptuženog Milenka Kuzmanovića zatražila je njegovo puštanje iz pritvora kako bi se mogao braniti sa slobode, što je sudsko vijeće odbilo.
Sudac Vučinić nastavak postupka zakazao je za 20. travnja, kada se očekuje da videovezom iz Hrvatske budu ispitani sudski vještaci koji su obavili telekomunikacijsko vještačenje u istrazi provedenoj nakon ubojstva Pukanića i Franjića.
Optužnicom posebnog državnog odvjetništva u Beogradu Sreten Jocić, Željko Milovanović i Milenko Kuzmanović terete se za kaznena djela zločinačkog udruživanja i teškog ubojstva. Oni su optuženi da su za novčanu nagradu, ne manju od 1,5 milijuna eura, nakon duljeg praćenja Pukanića, u listopadu 2008. pripremili eksplozivnu napravu koju su postavili na kupljeni skuter, koji je dovezen i parkiran uz Pukanićev automobil u dvorištu njegove medijske tvrtke u Zagrebu.
Za ubojstvo Pukanića i Franjića na zagrebačkome Županijskom sudu 3. studenoga izrečene su presude šestorici optuženih, među kojima i Milovanoviću, kojemu se sudilo u odsutnosti.
Robert Matanić, koji je po optužnici okupio zločinačku skupinu, osuđen je na 33 godine zatvora. Zbog pomaganja u ubojstvu, njegov bratić Luka Matanić i zajednički prijatelj Amir Mafalani dobili su po 16 godina zatvora.
Neposredni počinitelj Željko Milovanović, optužen da je aktivirao eksplozivnu napravu koja je raznijela Pukanića, u odsutnosti je osuđen na 40 godina zatvora, a Bojan Gudurić dobio je 30-ogodišnju zatvorsku kaznu jer je iz zasjede trebao pucati u Pukanića ako eksploziv zataji.
Slobodan Đurović osuđen je na 15 godina zatvora zbog optužaba da je bio veza ubojica sa Sretenom Jocićem, zvanim Joca Amsterdam, koji je za Pukanićevo ubojstvo navodno platio 1,5 milijuna eura.