Poruku Svetog Oca pročitao je večeras u zagrebačkoj prvostolnici pročelnik Kongregacije za nauk vjere u Vatikanu kardinal William Joseph Levada, koji je predovdio misno slavlje.
U poruci se kaže:
"Dana 30. prosinca 1981. u Rimu je svoj zemaljski život završavao uzoriti gospodin kardinal Franjo Šeper, bivši nadbiskup zagrebački i pročelnik Kongregacije za nauk vjere od 1968. do 1981.
Sjećanje na njega u meni je veoma živo još iz vremena Drugoga vatikanskog sabora, iz kojega pamtim njegove nastupe tijekom koncilskih zasjedanja. Kasnije sam imao priliku upoznati ga dublje, prigodom sjednica Međunarodne teološke komisije, osnovane 1969., kojoj je predsjedao kardinal Šeper, a ja sam od sama početka bio imenovan njezinim članom. Konačno sam ga susreo 1981., kad sam ga naslijedio na dužnosti pročelnika Kongregacije za nauk vjere.
Iz poznavanja osobnosti i djela kardinala Šepera izranja svjedočanstvo jednoga života, koji je bio osobito posvećen ispovijedanju vjere u oživotvorenju ljubavi prema čovjeku na službu Crkve. Uistinu, kao pastir i teolog kardinal je znao spojiti dobrotu, jednostavnost i odlučnost.
Ostaje nezaboravan njegov pastoralni rad, najprije kao nadbiskupa-koadjutora, a zatim, od 1960. - nakon što je naslijedio blaženoga Alojzija Stepinca - kao nadbiskupa metropolita zagrebačke Crkve i kao predsjednika Biskupske konferencije Jugoslavije, neumorno se zalažući za hrvatski narod u zahtjevnim i teškim trenutcima komunističkoga totalitarizma. Jednako je tako bilo važno njegovo sigurno i razborito služenje u vođenju Kongregacije za nauk vjere tijekom triju pontifikata. Poseban spomen zavrjeđuje djelo koje je ostvareno pod njegovim vodstvom, a tiče se preustroja i reorganizacije toga Dikasterija unutar Crkve u skladu sa zahtjevima Drugoga vatikanskog sabora. Na isti je način vrijedno spomenuti stav mudrosti, duboka poštovanja prema osobama koje je susretao te čvrstu i jasnu usmjerenost koju je znao naznačiti za djelovanje Kongregacije, Papinske biblijske komisije i Međunarodne teološke komisije, radi pozitivnijega i podanašnjenijega predstavljanja katoličkoga nauka. Odlučujuća je bila njegova uloga u brojnim i važnim dokumentima doktrinarnoga i moralnoga značaja koje je, pod njegovim vodstvom, objavila Kongregacija i druga dva spomenuta tijela.
Iz njegova života i primjera nedvojbeno je da je kardinal Franjo Šeper nosio živu i žarku želju svjedočiti vjeru i ljubav za istinu, pomažući papama u njihovoj službi i u vođenju cijeloga kršćanskog puka. Njegova osobnost ostaje jasno svjedočanstvo sjajna lika sveopće Crkve u 20. stoljeću", poručio je Papa, uz apostolski blagoslov "dragomu hrvatskom narodu".